Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms