Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms