Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYLDQ9NQC7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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