Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms