Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPEF2Q9C093 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPEF2Q9C093 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms