Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms