Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms