Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4AQ9BY43 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms