Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDAC8Q9BY41 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms