Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms