Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THUMPD2Q9BTF0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms