Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms