Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms