Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms