Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms