Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms