Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms