Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms