Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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