Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms