Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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