Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CSNK2A3Q8NEV1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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