Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms