Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASP1Q7Z460 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLASP1Q7Z460 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms