Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms