Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPB1

cDNA FLJ26142 fis, clone TST04526, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZPB1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6ZPB1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6ZPB1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms