Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms