Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6P435 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6P435 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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