Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms