Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms