Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms