Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms