Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms