Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms