Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms