Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms