Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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