Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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