Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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