Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms