Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SF1Q15637 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SF1Q15637 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SF1Q15637 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SF1Q15637 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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