Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MLC1Q15049 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MLC1Q15049 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms