Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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