Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms