Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms