Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ERV3-1Q14264 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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