Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms