Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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