Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms