Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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